Fondé au 13ème siècle par Jeanne de Constantinople, comtesse de Flandres, incendié en 1468, l'Hospice Comtesse est reconstruit avant la fin du 15ème siècle.
De nouveaux bâtiments s'ajoutent au 16ème siècle, notamment le bâtiment bordant la rue de la Monnaie. Un dernier bâtiment achevé en 1724 ferme la cour d'honneur.
Avec le transfert des malades vers l'hôpital Saint Sauveur à la Révolution française, l'hôpital Comtesse, n'accueille alors plus que les vieillards et les orphelins.
"Désaffecté en 1939, l'hôpital fait l'objet en 1943 d'un bail emphytéotique entre la municipalité lilloise et l'administration des hospices qui stipule l'obligation de le transformer en musée. Aujourd'hui, il présente la vie sociale et culturelle à Lille et dans les Pays-Bas aux 17ème et 18ème siècles." © Pôle ressources du Patrimoine Hospitalier et Médical du Nord
Bâtiments du 15ème et du 17ème siècle classés Monuments historiques (décret du 14 avril 1923) ; façades et toitures de l'ensemble des autres bâtiments classés Monuments historiques (arrêté du 26 février 1991)