L'église de Merris datant d'avant le XVIème siècle a été détruite lors de la première guerre mondiale, il s'agissait d'une hallekerque (3 nefs) caractéristique des Flandres.
A la Reconstruction, le parti pris architectural est de ne pas reconstruire à l'identique. Le style néo-régionaliste s'impose à Merris.
La première pierre de l'église est posée en 1926, le plan de reconstruction est porté par les architectes Albert BRAY et HENNEQUET Frères. Ils réalisent un clocher ajouré par des abats-sons.
Les vitraux remarquables sont l'oeuvre du Maître-Verrier Jacques GRUBER.
Après la suppression de la flèche de l'église, jugée dangereuse, en 1976, l'édifice est en cours de restauration depuis février 2015.